【Primer Premier 6激活版下载】Primer Premier 6引物设计软件 v6.24 中文激活版
软件介绍
Primer Premier 6破解版是一款在基因工程专业上会经常使用到的引物设计软件,我们可以通过Primer Premier 6中文版来完成引物设计、序列编辑、酶切分析等多种操作,并且这款软件还可以帮助用户快速分析各项数据,获取最为准确的结论数据。
Primer Premier 6破解版软件简介
primer premier 6.0是一款功能强大的基因分析软件,软件分享了自动同源性和避免模板结构、多序列比对、致病性检测、SNP基因型分析引物设计、手动引物搜索、多重检测、编辑模板序列等功能丰富的功能,并具备了一个所见所得的操作面板,而且所有常用的工具直接集成在工具栏上,用户能够轻松的进行使用,该程序非常适用于科学家与生物研究人员进行聚合酶链反应分析。
软件特色
1、主要界面可分为序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和纹基分析窗口(Motif)四大块
2、该软件就是用来进行引物设计的
3、可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物
4、在手动的任何时候,下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异 二聚体、发夹结构等。也可以给定条件,让软件自动搜索引物,并将引物分析结果显示出来
5、进行这些操作非常简单
Primer Premier 6破解版软件功能
CR引物设计 – 设计引物对用于PCR和多重实验。
跨物种 – 扩增来自多个物种的序列。
致病性检测 – 在高度保守的区域中定位寡核苷酸。
等位基因特异性 – 仅扩增一组相关序列中的单个成员。
简并 – 从氨基酸序列开始,反向翻译并自动设计低简并区域的寡核苷酸。
嵌套/多重 – 检查多个候选寡核苷酸之间的同源性。
限制酶和基序分析 – 从数据库中选择800多种酶和200种常见基序。
Clustal W比对 – 使用任何资源(包括EBI)在执行ClustalW比对后加载比对序列。
多序列比对 – 使用流行的Clustal W算法来对齐桌面上的序列(仅适用于Windows版本)。
算法 – 使用Breslauer值计算Tm。
长PCR – 处理最多50 KB的序列。
Primer Premier 6破解版安装步骤
1、下载并解压Primer Premier和算号器压缩包;
2、安装并运行Primer Premier(如图1);
3、点击Activate Product(如图2);
4、运行算号器,在Machine ID中输入上图所示数字,点击Generate(如图3);
5、将上图所示Activation Key输入图2中,出现如下提示(如图4)。
到此,Primer Premier已被成功激活,即可正常使用。
Primer Premier 6破解版使用技巧
一、限制性酶切点分析及基元查找功能
1.其主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切点分析及基元查找功能比较简单,点击该功能按钮后,选择相应的限制性内切酶或基元(如-10 序列,-35 序列等),按确定即可
2.常见的限制性内切酶和基元一般都可以找到,你还可以编辑或者添加新限制性内切酶或基元
二、引物设计
1.打开DNA序列后点击按钮primer,出现“search criteria”窗口,有多种参数可以调整
2.搜索目的(Seach For)有三种选项,PCR 引物(PCR Primers)、测序引物(Sequencing Primers)和杂交探针(Hybridization Probes)
3.搜索类型(Search Type)可选择分别或同时查找上、下游引物(Sense/Anti-sense Primer,或Both),或者成对查找(Pairs),或者分别以适合上、下游引物为主(Compatible with Sense/Anti-sense Primer)。另外还可改变选择区域(Search Ranges),引物长度(Primer Length),选择方式(Search Mode),参数选择(Search Parameters)等等
3.使用者可根据自己的需要设定各项参数。如果没有特殊要求,建议使用默认设置。然后按search,随之出现的Search Progress 窗口中显示Search Completed 时,再按OK,这时搜索结果以表格的形式出现,有三种显示方式,上游引物(Sense),下游引物(Anti-sense),成对显示(Pairs)。默认显示为成对方式,并按优劣次序(Rating)排列,满分为100,即各指标基本都能达标
三、引物点击
1.点击其中一对引物,如第1#引物,并把上述窗口挪开或退出,显示“Peimer Premier”主窗口,所得结果分三部分,
2.模板及产物位置,中间是所选的上下游引物的一些性质,最下面是四种重要指标的分析,包括发夹结构(Hairpin),二聚体(Dimer),错误引发情况(False Priming),及上下游引物之间二聚体形成情况(Cross Dimer)
3.当所分析的引物有这四种结构的形成可能时,按钮由变成,点击该按钮,在左下角的窗口中就会出现该结构的形成情况
4.一对理想的引物应当不存在任何一种上述结构,因此最好的情况是最下面的分析栏没有,只有。值得注意的是中间一栏的末尾给出该引物的最佳退火温度
四、引物修饰编辑
1.在需要对引物进行修饰编辑时,如在5’端加入酶切位点,可点击,然后修改引物序列
2.若要回到搜索结果中,则点击按钮。如果要设计简并引物,只需根据源氨基酸序列的物种来源选择前述的八种遗传密码规则,反推至DNA 序列即可3.对简并引物的分析不需像一般引物那样严格
4.总之,“Premier”有优秀的引物自动搜索功能,同时可进行部分指标的分析,而且容易使用,是一个相当不错的软件
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